Database della struttura proteica AlphaFold di DeepMind

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Alcuni giorni fa, DeepMind (società consociata di Google) rilasciato il suo tanto atteso database della struttura proteica AlphaFold 2. Per essere precisi, il progetto era in collaborazione con il Laboratorio Europeo di Biologia Molecolare (EMBL).

Il progetto originale AlphaFold iniziato nel dicembre 2018. Il Articolo sulla natura fornisce un riassunto completo di quest’ultima scoperta. Il CEO e fondatore di DeepMind è il Dr. Demis Hassabis.

L’azienda britannica è diventata famosa grazie ai suoi programmi AlphaGo e AlphaZero. Questi programmi hanno imparato da soli a giocare a Go, Chess e Shogi giocando da soli per diversi giorni. Sono stati quindi in grado di sconfiggere i migliori giocatori umani e supercomputer del mondo di quei giochi.

Sono molto sorpreso che questo sviluppo rivoluzionario non sia stato menzionato da nessun lettore. Probabilmente avrà implicazioni positive per i futuri trattamenti contro la caduta dei capelli. È interessante notare che il lettore “Quentin” ha recentemente fatto un commento molto utile sugli amminoacidi, che sono strettamente correlati alle proteine.

Punti salienti di AlphaFold 2

Tra i punti salienti di questo database AlphaFold ad accesso libero online disponibile gratuitamente:

“Questo sarà uno dei set di dati più importanti dalla mappatura del genoma umano”. — Dott. Ewan Birney (Direttore EMBL-EBI).

  • Lo strumento di intelligenza artificiale AlphaFold 2 di DeepMind ha fornito una struttura 3D a 350.000 proteine.
  • Ciò include una mappa delle circa 20.000 proteine ​​espresse dal genoma umano. Conosciuto anche come proteoma.
  • AlphaFold sta già aiutando gli scienziati accelerare la scoperta di farmaci.
  • Nei prossimi mesi. DeepMind prevede di espandere notevolmente la copertura a quasi tutte le proteine ​​sequenziate conosciute dalla scienza (oltre 100 milioni di strutture nel Banca dati UniProt).
  • Questo lavoro di calcolo rappresenta uno straordinario progresso nel cinquantenne problema di ripiegamento delle proteine in biologia.
  • Cambierà tutto (?).

“Con questa risorsa liberamente e apertamente disponibile, la comunità scientifica sarà in grado di attingere alla conoscenza collettiva per accelerare la scoperta, inaugurando una nuova era per la biologia abilitata all’intelligenza artificiale”. — Dr. Paul Nurse (Direttore del Francis Crick Institute).

Proteine ​​contro la caduta dei capelli

Sembra che questa tecnologia sia matura per aiutare ad accelerare lo sviluppo di trattamenti per la caduta dei capelli. E aiutando a capire il motivo della caduta dei capelli.

Per molto tempo, molte persone hanno suggerito che una cura per la caduta dei capelli non deve comportare solo l’annientamento completo del (DHT). Ad esempio, vedi il mio post sulla proteina Krox20 (EGR2).

Solo per il gusto di farlo, l’ho fatto una ricerca di “capelli” nella banca dati. Ha prodotto 175 risultati:

Risultati della ricerca di proteine ​​AlphaFold 2.

Altre risorse open source

Stiamo vedendo sempre più database online gratuiti e risorse ad accesso aperto a vantaggio dei ricercatori sulla perdita dei capelli. Oltre al generale DeepMind/AlphaFold GitHub, abbiamo anche quelli specifici per capelli come il BiernaskieLab GitHHub.

Hai anche risorse come Driskell Lab’s skinregeneration.org dove è possibile cercare grandi set di dati relativi a cicatrici e tessuti rigenerativi. Vedi il mio post correlato sulla rigenerazione della pelle, la guarigione delle ferite e la crescita dei capelli.

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